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大豆籽粒不同發育時期的轉錄組分析

陳錦玲; 徐媛; 陳玉梅; 李璐璐; 李惠敏; 秦新民 廣西師范大學生命科學學院; 廣西桂林541004

關鍵詞:大豆 差異表達基因 油脂合成 轉錄組測序 

摘要:為了從分子水平上研究大豆籽粒不同發育時期的油脂合成與累積機理,對大豆開花20 d(DD20)、30 d(DD30)、40 d(DD40)、50 d(DD50)的籽粒進行了轉錄組測序。通過對轉錄組測序數據的分析,共得到原始數據461 566 988條,經過濾獲得開花后20,30,40和50 d的clean reads,分別為107 548 920,111 670 776,109 339 672和108 884 270條。DD20/DD30、DD30/DD40、DD40/DD50比較組中的差異表達基因分別為4 759,6 245和13 763個,其中上調基因分別為1 801,2 941和5 695個。差異表達基因的KEGG pathway分析中,分別得到134,133和136條代謝通路,篩選到8個與油脂合成相關的差異表達基因,ACC、FATB、GPAT、DGAT1、G3PDH、KASI、SAD和FAD2。研究結果對深入研究大豆籽粒脂質合成的調控機理及大豆高油育種具有重要參考價值。

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