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基于輻射防護(hù)基因集的抗輻射損傷先導(dǎo)化合物預(yù)測
關(guān)鍵詞：先導(dǎo)化合物 輻射防護(hù)劑 基因表達(dá)譜 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù) lincs計(jì)劃
摘要：目的利用基于網(wǎng)絡(luò)的細(xì)胞反應(yīng)印記整合文庫(LINCS)計(jì)劃的小分子化合物刺激不同細(xì)胞系的轉(zhuǎn)錄譜數(shù)據(jù),構(gòu)建算法評(píng)估化合物的抗輻射損傷活性,發(fā)現(xiàn)抗輻射損傷先導(dǎo)化合物。方法基于基因本體(gene ontology,GO)數(shù)據(jù)庫構(gòu)建輻射防護(hù)基因集,并基于基因集富集分析算法構(gòu)建算法評(píng)估化合物的抗輻射損傷潛能,預(yù)測具有抗輻射損傷活性的先導(dǎo)化合物。結(jié)果建立了4個(gè)具有抗輻射損傷效果的輻射防護(hù)基因集,以及利用轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)預(yù)測抗輻射損傷先導(dǎo)化合物的方法;在32 560個(gè)小分子化合物中預(yù)測獲得了299個(gè)抗輻射損傷先導(dǎo)化合物,其中17個(gè)已被報(bào)道具有抗輻射損傷活性。結(jié)論預(yù)測結(jié)果具有較好參考價(jià)值;預(yù)測方法速度快,成本低,可有效發(fā)現(xiàn)具有抗輻射損傷活性的化合物。
軍事醫(yī)學(xué)雜志要求:
{1}正文前要有300字左右的中文摘要，3～6條中文關(guān)鍵詞，中圖分類號(hào)，與中文對應(yīng)的英文題目、摘要和關(guān)鍵詞，參考文獻(xiàn)完整。
{2}數(shù)字：執(zhí)行GB/T15835-1995《關(guān)于出版物上數(shù)字用法的規(guī)定》。公歷世紀(jì)、年代、月、日、時(shí)刻和計(jì)數(shù)、計(jì)量均用阿拉伯?dāng)?shù)字。
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{4}來稿稿件應(yīng)包括題目、摘要、關(guān)鍵詞、正文和參考文獻(xiàn)等內(nèi)容。來稿文責(zé)自負(fù)，本刊有稿件刪改權(quán)，如不同意，請來稿時(shí)注明。
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{9}稿件應(yīng)文字精練，層次清晰，觀點(diǎn)明確，論據(jù)充分，數(shù)據(jù)可靠，說服力強(qiáng)。
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