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龍眼類受體蛋白激酶CRK家族全基因組鑒定及表達調控分析
關鍵詞：龍眼 crk 基因家族 鑒定 表達調控
摘要：為了解龍眼富含半胱氨酸的類受體蛋白激酶(cysteine-rich receptor-like kinase,CRK)家族的基本特征與功能,本研究采用生物信息學分析方法對篩選出的98個龍眼CRK基因家族的成員進行分析鑒定,包括分子進化樹的構建和對蛋白結構域及其特性、啟動子及其順式作用元件、體胚發(fā)生的過程以及組織器官特異性表達的分析。結果顯示:通過對龍眼和擬南芥CRK基因做進化樹分析,可根據親緣關系的遠近將其分為7個亞家族;不同亞家族成員的蛋白質特性(氨基酸數量、相對分子質量、等電點、信號肽及糖基化位點)有所不同;各成員基因結構特性,啟動子順式作用元件,蛋白結構域特性等與進化樹中家族成員親緣關系的遠近相關;98個CRK家族成員在體胚發(fā)生過程(NEC、EC、ICpEC、GE)以及生長發(fā)育過程中組織器官特異性表達情況有所不同,其中在非胚性愈傷組織以及幼果中表達量較高,在種子和果實中幾乎未表達。此外,富含半胱氨酸的類受體蛋白激酶在生物脅迫、非生物脅迫(抗病蟲害、抗旱、抗寒、抗鹽脅迫等)以及在植物生長發(fā)育過程中起著重要作用。
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